Tiene por misión la puesta en práctica de las políticas y orientaciones del directorio. Es responsable de asegurar la estrategia de trabajo de las UNIDADES DE TRABAJO, del monitoreo de las variables del entorno que nutren el accionar de AEQUALIS y mantener sistemáticamente informado al directorio tanto de las líneas de trabajo así como de los recursos empleados para ello.
Los integrantes de la Secretaría Ejecutiva son nombrados por el directorio y permanecen mientras cuenten con su confianza.
Gonzalo Puentes Soto,
Secretario Ejecutivo
Ingeniero forestal Universidad de Concepción, magíster en administración de empresas Universidad Austral de Chile. Vicerrector de Aseguramiento de la Calidad, Universidad San Sebastián.
José Venegas Lillo,
jefe de Estudios
Ingeniero Forestal Universidad Catolica de Temuco, magíster en administración de empresas Universidad Mayor. Director de Calidad de los Aprendizajes, Universidad Autónoma de Chile.
Georgina Sánchez Fernández
Coordinadora Ejecutiva
Asistente ejecutiva y de gestión.
Angélica Cabello Pacheco,
jefa de Comunicaciones
Periodista Pontificia Universidad Católica de Chile.
Manuel F. Daniel Bauerle,
periodista
Periodista Universidad de Chile, magíster Comunicación Estratégica U. Finis Terrae.
Marietta Radnic Franulic,
periodista
Periodista Pontificia Universidad Católica de Chile.